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課題組介紹
劉毓文，研究員、博士生導(dǎo)師。入選國(guó)家重大人才工程（青年）、廣東省高層次人才（青年）、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類、深圳市高層次人才B類，深圳市“青年五四獎(jiǎng)?wù)隆鲍@得者。2006年于清華大學(xué)本科畢業(yè)，2014年在芝加哥大學(xué)取得博士學(xué)位。劉毓文研究員在基因組和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域有著十多年的科學(xué)研究經(jīng)歷，在學(xué)術(shù)研究上擅長(zhǎng)開發(fā)并利用實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，從非編碼順式調(diào)控區(qū)入手解析復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)，以及基于細(xì)胞調(diào)控線路設(shè)計(jì)的合成生物學(xué)育種。
以通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Research，Nature Communications, Nucleic Acids Research, Advanced Science等高水平雜志上發(fā)表多篇文章， Google Scholar總引用1800多次。開發(fā)了WHG-STARR-Seq和Ss-STARR-Seq實(shí)驗(yàn)方法，分別首次實(shí)現(xiàn)了哺乳動(dòng)物全基因組增強(qiáng)子和沉默子的高通量直接定量；開發(fā)了等位基因特異性allele-specific STARR-Seq，首次測(cè)定了上萬(wàn)GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對(duì)增強(qiáng)子功能影響；開發(fā)了統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)算法TADA-Annotation，首次將整合增強(qiáng)子功能性變異等多種功能基因組注釋用于挖掘挖掘復(fù)雜性狀因果基因的方法拓展到新生突變。開發(fā)了DREAM算法實(shí)現(xiàn)基于AI的順式調(diào)控元件從頭設(shè)計(jì)，在多個(gè)物種中獲得了超過目前最強(qiáng)活性的增強(qiáng)子序列，產(chǎn)生了首個(gè)基因組中整合入AI設(shè)計(jì)增強(qiáng)子的成體動(dòng)物。在動(dòng)物遺傳育種領(lǐng)域，率先利用等位基因特異性STARR-Seq，從增強(qiáng)子功能性變異為切入點(diǎn)，挖掘了生豬產(chǎn)肉相關(guān)性狀的潛在因果調(diào)控型變異和功能基因。開發(fā)了基于靶向二代測(cè)序的伴侶動(dòng)物基因檢測(cè)液相芯片，可以通過品系鑒定，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率，獲批三項(xiàng)國(guó)家專利，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬(wàn)元進(jìn)行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化。開發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的基因型分型計(jì)算方法，領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動(dòng)物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺(tái)，首次實(shí)現(xiàn)了單個(gè)動(dòng)物囊胚的全基因組SNP準(zhǔn)確分析，為胚胎基因組選擇提供了重要工具，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強(qiáng)，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名，并以此平臺(tái)依托基因組所孵化了中農(nóng)芯躍分子育種公司，該高效低成本基因組選擇平臺(tái)于2023年獲得《中國(guó)科學(xué)報(bào)》、《中央人民廣播電臺(tái)大灣區(qū)之聲》等多家媒體的專題報(bào)道。主持十四五國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題、國(guó)家自然科學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)面上項(xiàng)目等國(guó)家級(jí)項(xiàng)目4項(xiàng)，主持深圳市科創(chuàng)委項(xiàng)目1項(xiàng)，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研計(jì)劃、十四五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等多項(xiàng)項(xiàng)目。

一、招聘崗位
根據(jù)團(tuán)隊(duì)工作需要，擬面向?qū)櫸锘驒z測(cè)項(xiàng)目招聘科研助理1名。
二、崗位職責(zé)
1、按照SOP流程進(jìn)行樣本數(shù)據(jù)的分析與整理；
2、根據(jù)需求改善上述分析流程，提高分析效率；
3、根據(jù)領(lǐng)導(dǎo)或者業(yè)務(wù)安排開發(fā)新的動(dòng)物數(shù)據(jù)分析方案；
4、匯報(bào)開發(fā)和工作進(jìn)程，對(duì)于工作中出現(xiàn)的問題能夠做出分析與判斷，并且及時(shí)向上級(jí)報(bào)告；
5、負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)部門人員工作實(shí)驗(yàn)室辦公室的管理工作；
6、完成上級(jí)或領(lǐng)導(dǎo)交代的其他工作。
三、崗位要求
1、1年以上生物信息學(xué)分析相關(guān)經(jīng)驗(yàn)（學(xué)界業(yè)界皆可）
2、熟悉Python編程語(yǔ)言，或熟悉R編程語(yǔ)言且有基本Python編程基礎(chǔ)
3、熟悉Python或R畫圖
4、熟悉命令行操作環(huán)境，或RStudio，或Jupyter Notebook / Jupyter Lab操作環(huán)境
5、熟悉WGS，WES，RNA-Seq，SNP array數(shù)據(jù)中任一種，及其相關(guān)的至少一種數(shù)據(jù)分析流程
6、具備基本英文文獻(xiàn)閱讀能力。

四、薪資待遇
1. 7000~14000元/月，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個(gè)人具體條件確定。
2. 繳納深圳市五險(xiǎn)一金。
3. 提供良好的科研環(huán)境，有機(jī)會(huì)發(fā)表文章、課題組過往科研助理大部分都到國(guó)內(nèi)外名校繼續(xù)深造讀博。

五、申請(qǐng)方式
申請(qǐng)者可將個(gè)人簡(jiǎn)歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表、國(guó)內(nèi)外任職證明、個(gè)人最高學(xué)術(shù)水平成果、項(xiàng)目、專利證書和獎(jiǎng)勵(lì)等）、代表作、未來(lái)計(jì)劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至liuyuwen @caas.cn，并抄送suluanxin @caas.cn（因網(wǎng)站屏蔽郵箱，發(fā)送時(shí)請(qǐng)刪除@前面一個(gè)空格），郵件主題和材料壓縮文件請(qǐng)注明“姓名+崗位”。
應(yīng)聘者材料將嚴(yán)格保密，并在通過簡(jiǎn)歷篩選者將安排面試，未進(jìn)入面試者，不再另行告知。